Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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LINC00587B1AMM8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LINC00587B1AMM8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LINC00587B1AMM8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LINC00587B1AMM8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LINC00587B1AMM8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LINC00587B1AMM8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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LINC00587B1AMM8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00587B1AMM8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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