Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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