Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ODF3BA8MYP8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF3BA8MYP8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms