Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A8MVJ9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A8MVJ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A8MVJ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
A8MVJ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms