Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CYSRT1A8MQ03 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms