Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8JA6NMD2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8JA6NMD2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms