Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD3A6NKT7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RGPD3A6NKT7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RGPD3A6NKT7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms