Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTL1A6NKG5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms