Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC160A6NGH7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC160A6NGH7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms