Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf60A6NFR6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C5orf60A6NFR6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms