Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBFOX3A6NFN3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBFOX3A6NFN3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBFOX3A6NFN3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBFOX3A6NFN3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBFOX3A6NFN3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms