Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PALM3A6NDB9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms