Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRAMEF22A3QJZ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms