Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VWA8A3KMH1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VWA8A3KMH1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms