Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM89A2RUT3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM89A2RUT3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms