Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf170A2RU37 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms