Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPDC1A2A3K4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms