Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRGMA1A4Y4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRGMA1A4Y4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms