Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCOA3Q9Y6Q9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCOA3Q9Y6Q9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms