Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN6Q9Y6Q1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN6Q9Y6Q1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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