Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP3Q9Y6F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP3Q9Y6F1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms