Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRELID3BQ9Y3B1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms