Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
THRAP3Q9Y2W1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms