Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVW-1Q9UQF0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVW-1Q9UQF0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms