Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMC3Q9UQE7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMC3Q9UQE7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms