Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEU3Q9UQ49 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEU3Q9UQ49 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms