Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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