Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS5Q9UPZ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms