Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SORCS3Q9UPU3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS3Q9UPU3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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