Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CIZ1Q9ULV3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIZ1Q9ULV3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms