Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
INO80Q9ULG1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
INO80Q9ULG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms