Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO3Q9UK99 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO3Q9UK99 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms