Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MID2Q9UJV3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms