Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLXNA1Q9UIW2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms