Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAX2Q9UIW0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAX2Q9UIW0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms