Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN11AQ9UI33 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms