Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4Q9UBX2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms