Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
DKK2Q9UBU2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms