Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms