Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CC2D2AQ9P2K1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CC2D2AQ9P2K1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CC2D2AQ9P2K1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms