Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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USP35Q9P2H5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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USP35Q9P2H5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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USP35Q9P2H5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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USP35Q9P2H5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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USP35Q9P2H5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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USP35Q9P2H5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP35Q9P2H5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
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