Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN3Q9P232 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms