Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP1Q9NZU7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms