Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD4Q9NZQ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD4Q9NZQ9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
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