Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms