Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC10Q9NYD6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC10Q9NYD6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms