Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VNN3Q9NY84 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VNN3Q9NY84 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms