Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO28Q9NVF7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms