Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM30AQ9NV96 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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