Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PDS5BQ9NTI5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PDS5BQ9NTI5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.4 ms